Hast du außer der Datenbank auch die Ordner mit den thumbs etc gelöscht? Dort liegen importierte Files.
Falls du noch einen Versuch machen möchtest, würde ich das gesamte Verzeichnis in ProgramData entfernen bzw umbenennen. Dann geht dir nichts verloren. Vorher den Server-Dienst stoppen.
Wenn du umbenennst, machst du nichts platt: die alten Daten bleiben erhalten. Wenn du aber umbenennst, würde ich MP komplett deinstallieren und das Programmverzeichnis löschen, falls da noch irgendetwas übrig ist.
Dann neu installieren und mit den Serien anfangen und auf deine alten Probleme prüfen. Also Anzeiger der Serien und Episoden.
Erst dann die Filme angehen.